Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GIMD1P0DJR0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GIMD1P0DJR0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms