Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHA1P01876 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms