Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms