Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGR3O43761 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms