Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SOCS1O15524 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms