Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
E2F3O00716 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
E2F3O00716 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F3O00716 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F3O00716 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F3O00716 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms