Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E9PCH4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E9PCH4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E9PCH4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
E9PCH4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E9PCH4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
E9PCH4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E9PCH4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E9PCH4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E9PCH4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E9PCH4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E9PCH4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
E9PCH4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E9PCH4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
E9PCH4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E9PCH4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
E9PCH4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E9PCH4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
E9PCH4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
E9PCH4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
E9PCH4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms