Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms