Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLTPD2A6NH11 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms