Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCP1A6NGW2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms