Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC61Q9Y6R9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC61Q9Y6R9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms