Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SNX13Q9Y5W8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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