Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT172Q9UG01 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms