Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS29Q9UBQ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms