Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DKK3Q9UBP4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms