Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms