Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABI3Q9P2A4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABI3Q9P2A4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABI3Q9P2A4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABI3Q9P2A4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABI3Q9P2A4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABI3Q9P2A4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABI3Q9P2A4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms