Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKIRAS2Q9NYR9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKIRAS2Q9NYR9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms