Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VNN3Q9NY84 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms