Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms