Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms