Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AP000688.3-201ENST00000445464 348 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SENP3Q9H4L4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms