Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BARHL1Q9BZE3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BARHL1Q9BZE3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms