Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF17Q9BXT8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms