Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
REPIN1Q9BWE0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
REPIN1Q9BWE0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
REPIN1Q9BWE0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
REPIN1Q9BWE0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
REPIN1Q9BWE0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
REPIN1Q9BWE0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms