Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS4Q9BT78 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms