Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT17Q9BSW7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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