Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GINS3Q9BRX5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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