Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms