Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRAMP1Q96RY5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRAMP1Q96RY5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms