Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HHIPQ96QV1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HHIPQ96QV1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms