Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCGB3A2Q96PL1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCGB3A2Q96PL1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms