Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
YTHDC1Q96MU7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YTHDC1Q96MU7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms