Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM227BQ96M60 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM227BQ96M60 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms