Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD8Q96LT4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms