Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ULK4Q96C45 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms