Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPTSSAQ969W0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPTSSAQ969W0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms