Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRIM63Q969Q1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRIM63Q969Q1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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