Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HPS3Q969F9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms