Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms