Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC112Q8NEF3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms