Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC21AQ8NDW8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms