Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACBD4Q8NC06 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms