Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF182Q8N6D2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF182Q8N6D2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms