Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP2Q8IXW5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms