Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC50Q8IVM0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms