Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG4DQ86TL0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms