Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC16A9Q7RTY1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC16A9Q7RTY1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms