Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCQ7RTU9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCQ7RTU9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms