Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM47EQ6ZV65 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms